用于植物和微生物育種是細(xì)胞融合技術(shù)基本的應(yīng)用領(lǐng)域。對(duì)微生物而言,該技術(shù)主要用于改良微生物菌種特性、提高目的產(chǎn)物的產(chǎn)量、使菌種獲得新的性狀、合成新產(chǎn)物等。與基因工程技術(shù)相結(jié)合,使對(duì)遺傳物質(zhì)進(jìn)一步修飾提供了各種各樣的可能性。目前,微生物細(xì)胞融合的對(duì)象已擴(kuò)展到酵母、霉菌、放線菌等多種微生物的種間以至屬間,不斷培育出用于各種領(lǐng)域的新菌種。自1979年首先利用微生物原生質(zhì)體融合技術(shù)提高青霉素產(chǎn)量以來,開創(chuàng)了原生質(zhì)體融合技術(shù)在實(shí)際工作中的應(yīng)用。微生物細(xì)胞融合技術(shù)的一項(xiàng)突出應(yīng)用是生物藥品的生產(chǎn),包括生物活性物質(zhì)、疫苗等。另一方面的突出應(yīng)用就是為發(fā)酵工業(yè)提供優(yōu)良菌種,例如日本味之素公司應(yīng)用細(xì)胞融合技術(shù)使產(chǎn)生氨基酸的短桿菌雜交,獲得比原產(chǎn)量高3倍的賴氨酸產(chǎn)生菌和蘇氨酸高產(chǎn)新菌株。釀酒酵母和糖化酵母的種間雜交,分離子后代中個(gè)別菌株具有糖化和發(fā)酵的雙重能力。日本國稅廳釀造試驗(yàn)所用該技術(shù)獲得了優(yōu)良的高性能謝利酵母來釀制西班牙謝利白葡萄酒獲得了成功。在基礎(chǔ)理論方面,研究外源DNA轉(zhuǎn)化、質(zhì)粒轉(zhuǎn)移、基因定位、病毒傳遞以及核與核、核與質(zhì)之間的關(guān)系等已取得重大進(jìn)展。